Il est Professeur Honoraire à l’Ecole Nationale des Ponts et Chaussées, Institut Polytechnique de Paris, où il a enseigné la Mécanique des Sols puis la Dynamique des Structures en 2ième et 3ième année. Parallèlement de 2000 à 2020 il enseigne comme Visiting Professor à l’University School for Advanced Studies (IUSS) à Pavie en Italie.

Alain Pecker est Président d’Honneur de l’Association Française de Génie Parasismique, ancien Président du Comité Français de Mécanique des Sols et de Géotechnique et membre de l’Académie des Technologies.